TRIAGEM VIRTUAL HIERÁRQUICA DE POTENCIAIS BIOATIVOS COM ATIVIDADE ANTIBIÓTICA A PARTIR DE DIBENZOFURANOS POLIOXIGENADOS CONTRA Staphylococcus aureus RESISTENTE À METICILINA (MRSA)
Staphylococcus aureus; dibenzofuranos polioxigenados; docking molecular.
O Sthapylococcus aureus é um microrganismo de alta morbidade e mortalidade, devido as cepas
que apresentam mecanismos de resistência a alguns dos principais antibioticos do mercado,
impulsionando a necessidade do desenvolvimento de novas opções terapeuticas para
tratamento. Neste contexto, o planejamento de medicamentos utilizando técnicas
computacionais é uma ferramenta que permite compreender, prever ou explicar o
comportamento de moléculas nos sistemas biológicos, otimizando tempo e recursos. Com os
avanços tecnológicos, tais métodos computacionais têm ganhado cada vez mais espaço no
planejamento e desenvolvimento de fármacos, tendo em vista seu papel preditivo, acelerando a
identificação de compostos bioativos. Nesse trabalho, envolvendo triagem virtual baseada em
ligantes e estruturas foram empregados técnicas computacionais para identificar potenciais
agentes antibacterianos contra cepas de S. aureus. Para alcançar este objetivo, as moléculas
foram selecionadas com base nos valores de Concentração Inibitória Mínima (MIC) para S.
aureus, variando 0,24 μg/mL a >30 μg/mL oriundas do estudo de Oramas-Royo et al. (2017),
o tetrahidroxibenzofurano, um agente antibacteriano com resultado promissor, foi adotado
como molécula pivô e oito moléculas derivadas foram consideradas para gerar o modelo
farmacóforico. Este modelo foi usado para realizar triagem virtual na plataforma Pharmit, por
meio deste resultado, foram selecionadas vinte e quatro moléculas da base de dados Molport®.
Utilizando o Índice de Tanimoto, calculado pelo servidor BindingDB, foi possivel selecionar
dezoito moléculas com maior similaridade estrutural em relação aos antibioticos comerciais
(meticilina e oxacilina). As predições de propriedades farmacocinéticas e toxicológicas
(ADME/Tox) foram realizadas nos servidores ProTox II e PREADMET. As moléculas que
apresentaram resultados satisfatorios nas análises farmacocinéticas e toxicológicas foram
apenas três (LB255, LB320 e LB415). A predição da atividade biologica das estruturas foi
realizada utilizando o programa PASS, a molécula LB320 apresentou potencial para atividade
antibacteriana. No estudo de Docking Molecular as moléculas promissoras LB255, LB320 e
LB415), apresentaram resultados significativos para ambos os alvos moleculares (4CJN e
TMK). A molécula promissora LB320 apresentou os melhores resultados nas simulações de
Docking. Os complexos obtidos serviram de ponto de partida para simulações de dinâmica
molecular, onde todos os ligantes permaneceram interagindo com o local de ligação, nenhum
deles se separou da proteína alvo, desta forma pode-se inferir que os resultados obtidos
utilizando o docking molecular foram satisfatórios, uma vez que o modo de interação obtido no
docking não sofreu alterações bruscas, portanto, sem grandes alterações no modo de ligação
dos compostos. Após as simulações de dinâmica molecular, os complexos foram novamente
avaliados quanto à sua energia de afinidade, como resultado, todos os complexos demonstraram
que podem permanecer interagindo espontaneamente. Na predição de acessibilidade sintética
(SA) realizada no AMBIT e no SwissADME mostraram que LB255 e LB415 podem ser
consideradas difíceis de sintetizar, porém a LB320 é considerado de fácil sintese. Em conclusão,
os resultados sugerem que estes ligantes, particularmente LB320, pode ligar-se fortemente aos
alvos estudados e pode ter propriedades ADME/Tox apropriadas em estudos experimentais.